את הסיור בגן הלאומי ציפורי מומלץ להתחיל במערכת המים. נחנה במגרש החניה לפי השילוט ונצעד בשביל היוצא ממנו לפי השילוט למסלול ששת הפירים.  לאחר צעידה של כ 100 מ' נגיע למאגר המים של ציפורי העתיקה. משמאלינו נראה את בור השיקוע דרכו הוזרמו המים למאגר, ואנו נרד למאגר דרך המדרגות מימין. אנו נפסע במאגר המים העצום כ 50 מ' עד שנגיע למדרגות שיובילו אותנו החוצה. נפנה שמאלה עם השביל למסלול ששת הפירים, ובכניסה למסלול נפגוש במתקן "עובר / לא עובר" הנמצא ליד הפיר הראשון  שימחיש לנו כמה צריך להתכופף במסלול, אנו נמשיך לצעוד על שביל העפר ומהפיר הרביעי נוכל להכנס לתוך מערכת המים [אסור להיכנס ללא פנסים]. לתוך מערכת המים יורד גרם מדרגות ארוך, תלול וצר המוביל אותנו אל בטן האדמה.  נצעד לאורך מערכת המים כ 90 מ' ובאמצע נבחין גם בפיר החמישי היורד אל המערכת. בפיר השישי נצא החוצה ממערכת המים ונצעד שמאלה למרכז המבקרים של הגן הלאומי ציפורי – כ 700 מ' בשביל נוח לצד שוחות ארוכות של שיחי צבר. אם הגענו למקום רק עם רכב אחד – מומלץ שהנהג יחזור חזרה [כ 400 מ'] למגרש החניה הראשון ויביא את הרכב למגרש החנייה ליד מרכז המבקרים.