הקמת האקווריום עלתה בקנה אחד עם תכנון עתידו של גן החיות התנ"כי, שכן האקווריום משלים את חווית הביקור בגן החיות, בכך שהוא מאפשר פעילות גם בקיץ החם ובחורף הקר ומזמן ביקורים גם בשעות החשיכה.

​לנגד עיני גן החיות עמדה גם העובדה שהאקווריום עתיד להפוך לאתר תיירות מרכזי בירושלים, ולכן הקמתו תתרום לנושא התיירות והכלכלה בעיר.

בצד הקמת האקווריום, לאחר הבנת הצרכים והיעדים השונים של גן החיות, וכדי להמשיך את פיתוח גן החיות כאתר תיירות מוביל, הוחלט כי בעתיד יתווספו בשטח ההרחבה של גן החיות גם "ספארי לילה", בית פרפרים, מרכז חינוכי בתחום שמירת טבע ועוד.