המקום הראשון בו מוזכרת בית שאן במקורות היהודיים הינה בתיעוד גורלם של שאול המלך ובניו אחרי הקרב בו מצאו את מותם: "וַיְהִי, מִמָּחֳרָת, וַיָּבֹאוּ פְלִשְׁתִּים, לְפַשֵּׁט אֶת-הַחֲלָלִים; וַיִּמְצְאוּ אֶת-שָׁאוּל וְאֶת-שְׁלֹשֶׁת בָּנָיו, נֹפְלִים בְּהַר הַגִּלְבֹּעַ.  וַיִּכְרְתוּ, אֶת-רֹאשׁוֹ, וַיַּפְשִׁטוּ, אֶת-כֵּלָיו; וַיְשַׁלְּחוּ בְאֶרֶץ-פְּלִשְׁתִּים סָבִיב, לְבַשֵּׂר בֵּית עֲצַבֵּיהֶם–וְאֶת-הָעָם.  וַיָּשִׂימוּ, אֶת-כֵּלָיו, בֵּית, עַשְׁתָּרוֹת; וְאֶת-גְּוִיָּתוֹ, תָּקְעוּ, בְּחוֹמַת, בֵּית שָׁן" (שמואל א, לא ח-י).

בימי שלמה המלח מוזכר ששלט שם נציב מתאמו בענה בן אחילוד -ככתוב במלכים א, ד, פס' י"ב : "תענך, מגידו "בית שאן אצל צרתנה מתחת ליזרעאל מבית שאן עד אבל מחולה עד מעבר ליקמעם"

העיר הרומאית  סקיתופוליס מוזכרת לראשונה במאות השניה/שלישית לפני הספירה.  בספר קדמוניות היהודים. העיר התחילה להבנות על-ידי חיל פרשים וקשתים מצבאו של אלכסנדר מוקדון שאחרי שכבשו את הארץ השתקעו בה. העיר של הסקיתים – שבט נייד שהשתקע – סקיתופוליס.

במאה שלישית לפנה"ס מתואר בספר קדמוניות היהודים איך העליבו תושבי בית שאן את יוסף הן טוביה, מבית תלמי, שבא לגבות מהם מיסים. כנקמה, הוא הרג את החשובים שבתושבים והעביר את רכושם לקיסר.  החשמונאים כבשו את המקום, והשאירו את תושבי המקום. במגילת תענית מוזכר יום טוב ביום שנכבשה בית שאן. חשיבותה של בית שאן עולה ככל שחשיבות מעבר הגבול לירדן עולה, וכיבוש המקום הזה בעבר הקנה שליטה על צומת דרכים מרכזית.פומפיוס – מגיע ב 63 לפנה"ס, לוקח מהיהודים ערים שכבשו החשמונאים – סקיטופוליס מוזכרת ברשימה, נבנית עיר רומית החל מ 33 לפנה"ס.

יוסף בן מתיתיהו מספר שבשנת 66  המורדים שבאו לפשוט על העיר גילו שהיהודים המקומיים מתנגדים להם יחד עם הרומאים, זה לא עזר ליהודים המקומיים שגורשו עי הרומאים מהעיר לחורשה סמוכה, כי פחדו שיהפכו לגיס חמישי בלילה. בלילה השלישי אחרי הגירוש הם טבחו את כל יהודי בית שאן שהיו מחוץ לעיר. התנהגות זו הייתה מאד משמעותית ואלעזר בו יאיר הזכיר אותה גם במצדה לפני הנפילה. אחרי המרד הגדול ממשיכה בית שאן להתקיים ולפי ממצא מהשטח כנראה שהתקיימה עד המאה השמינית בה נחרבה.

לאחר התצפית המרשימה מרחבת הכניסה לגן נרד לרחוב העמודים – שריד הקארדו של בית שאן הקדומה [רח' בכיוון צפון-דרום] שמולינו ונתחיל לסייר בעיר